Clasificación según la temperatura y composición de los manantiales
La característica fundamental para clasificar las fuentes se basa en la temperatura y la composición del agua. Por un lado, todos los manantiales de salud son ricos en aguas minerales.
Por otro lado, además de presentar una composición rica en minerales, si tienen una temperatura cálida, poseen aguas termales.
Clasificación según la presión hidrostática
Las fuentes también se pueden clasificar según la presión hidrostática. El agua del manantial, puede salir, por ejemplo, de forma moderada. En este caso, existe la misma presión entre la atmósfera y el lugar donde fluye el agua subterránea. A este tipo de fuentes, se le conoce con el nombre de descendentes (caída de agua).
Sin embargo, si la presión en el punto de salida del agua subterránea es mayor que la de la atmósfera, forma parte de la categoría de fuentes ascendentes.
Clasificación según el transcurso del agua
Se pueden diferenciar también teniendo en cuenta el contenido del agua y la actividad. Hay fuentes que transportan agua durante todo el año (las llamadas "fuentes perennes") y hay otras que están parcialmente secas (las llamadas "fuentes intermitentes").